MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 52982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009051	CGGT	2	8	280287	280294	0 %	25 %	50 %	25 %	126178252
6002	NC_009051	GGC	2	6	280300	280305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178252
6003	NC_009051	CGAGC	2	10	280426	280435	20 %	0 %	40 %	40 %	126178252
6004	NC_009051	CTG	2	6	280457	280462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178252
6005	NC_009051	GAC	2	6	280463	280468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178252
6006	NC_009051	ACCGCG	2	12	280479	280490	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126178252
6007	NC_009051	GCCGC	2	10	280517	280526	0 %	0 %	40 %	60 %	126178252
6008	NC_009051	TCGA	2	8	280616	280623	25 %	25 %	25 %	25 %	126178252
6009	NC_009051	GAA	2	6	280726	280731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178252
6010	NC_009051	CGA	2	6	280798	280803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178252
6011	NC_009051	GTC	3	9	280814	280822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178252
6012	NC_009051	AAGG	2	8	280826	280833	50 %	0 %	50 %	0 %	126178252
6013	NC_009051	TCGAAG	2	12	280881	280892	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126178252
6014	NC_009051	CAA	2	6	280918	280923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126178252
6015	NC_009051	GGCC	2	8	280957	280964	0 %	0 %	50 %	50 %	126178252
6016	NC_009051	ATC	2	6	280973	280978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178252
6017	NC_009051	AGG	2	6	280980	280985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178252
6018	NC_009051	GAAC	2	8	280999	281006	50 %	0 %	25 %	25 %	126178252
6019	NC_009051	TCG	2	6	281040	281045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178252
6020	NC_009051	ATG	2	6	281051	281056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178252
6021	NC_009051	CGGC	2	8	281083	281090	0 %	0 %	50 %	50 %	126178252
6022	NC_009051	CTG	2	6	281156	281161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178252
6023	NC_009051	TGC	2	6	281164	281169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178252
6024	NC_009051	GCCA	2	8	281223	281230	25 %	0 %	25 %	50 %	126178252
6025	NC_009051	AGGC	2	8	281384	281391	25 %	0 %	50 %	25 %	126178253
6026	NC_009051	CGT	2	6	281523	281528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178253
6027	NC_009051	TGC	2	6	281574	281579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178253
6028	NC_009051	CTGA	2	8	281608	281615	25 %	25 %	25 %	25 %	126178254
6029	NC_009051	GCAG	2	8	281659	281666	25 %	0 %	50 %	25 %	126178254
6030	NC_009051	TCG	2	6	281678	281683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178254
6031	NC_009051	AAG	2	6	281764	281769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178254
6032	NC_009051	TCC	2	6	281831	281836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178254
6033	NC_009051	CTTC	2	8	281844	281851	0 %	50 %	0 %	50 %	126178254
6034	NC_009051	GAG	2	6	281887	281892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178254
6035	NC_009051	CAG	2	6	281896	281901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178254
6036	NC_009051	GAA	2	6	281958	281963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178254
6037	NC_009051	CCCG	2	8	282217	282224	0 %	0 %	25 %	75 %	126178255
6038	NC_009051	GGC	2	6	282294	282299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178255
6039	NC_009051	TCT	2	6	282312	282317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178255
6040	NC_009051	GCTC	2	8	282354	282361	0 %	25 %	25 %	50 %	126178255
6041	NC_009051	CGA	2	6	282387	282392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178255
6042	NC_009051	CCG	2	6	282401	282406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178255
6043	NC_009051	A	6	6	282433	282438	100 %	0 %	0 %	0 %	126178255
6044	NC_009051	AG	3	6	282456	282461	50 %	0 %	50 %	0 %	126178255
6045	NC_009051	GAA	2	6	282472	282477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178255
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6049	NC_009051	CGA	2	6	282611	282616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178255
6050	NC_009051	CCG	2	6	282620	282625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178255
6051	NC_009051	CGA	2	6	282630	282635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178255
6052	NC_009051	AAG	2	6	282637	282642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178255
6053	NC_009051	AGA	2	6	282647	282652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178255
6054	NC_009051	ACCC	2	8	282666	282673	25 %	0 %	0 %	75 %	126178255
6055	NC_009051	CGA	2	6	282704	282709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178255
6056	NC_009051	ACC	2	6	282755	282760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178255
6057	NC_009051	GAT	2	6	282762	282767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178255
6058	NC_009051	TCG	2	6	282778	282783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178255
6059	NC_009051	GAG	2	6	282793	282798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178255
6060	NC_009051	CCG	2	6	282818	282823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178255
6061	NC_009051	CG	3	6	282833	282838	0 %	0 %	50 %	50 %	126178255
6062	NC_009051	CTC	2	6	282868	282873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178255
6063	NC_009051	CGT	2	6	282891	282896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178255
6064	NC_009051	GCT	2	6	282936	282941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178255
6065	NC_009051	GGA	2	6	283044	283049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178255
6066	NC_009051	CGT	2	6	283062	283067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178255
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6068	NC_009051	CGGGGA	2	12	283134	283145	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	126178255
6069	NC_009051	GTC	2	6	283168	283173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178255
6070	NC_009051	GAG	2	6	283216	283221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178255
6071	NC_009051	AGG	2	6	283292	283297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178255
6072	NC_009051	GCG	2	6	283357	283362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178255
6073	NC_009051	GAG	2	6	283363	283368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178255
6074	NC_009051	TCCC	2	8	283372	283379	0 %	25 %	0 %	75 %	126178255
6075	NC_009051	CGG	2	6	283484	283489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178255
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6085	NC_009051	TCG	2	6	283914	283919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178256
6086	NC_009051	TCC	2	6	283926	283931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178256
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6088	NC_009051	GC	3	6	283990	283995	0 %	0 %	50 %	50 %	126178256
6089	NC_009051	GTG	2	6	284000	284005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178256
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6091	NC_009051	G	6	6	284214	284219	0 %	0 %	100 %	0 %	126178256
6092	NC_009051	TCGC	2	8	284220	284227	0 %	25 %	25 %	50 %	126178256
6093	NC_009051	GAG	2	6	284234	284239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178256
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6103	NC_009051	CGC	3	9	284633	284641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178256
6104	NC_009051	CAC	2	6	284642	284647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178256
6105	NC_009051	GGGGA	2	10	284652	284661	20 %	0 %	80 %	0 %	126178256
6106	NC_009051	CCGG	2	8	284690	284697	0 %	0 %	50 %	50 %	126178256
6107	NC_009051	GATC	2	8	284761	284768	25 %	25 %	25 %	25 %	126178256
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6109	NC_009051	GCCG	2	8	285016	285023	0 %	0 %	50 %	50 %	126178257
6110	NC_009051	GC	3	6	285040	285045	0 %	0 %	50 %	50 %	126178257
6111	NC_009051	CGT	2	6	285115	285120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178257
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6121	NC_009051	GGGCGA	2	12	285441	285452	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	126178257
6122	NC_009051	TGT	2	6	285459	285464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178257
6123	NC_009051	CG	3	6	285534	285539	0 %	0 %	50 %	50 %	126178257
6124	NC_009051	TGC	2	6	285566	285571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178257
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6134	NC_009051	AGGG	2	8	285975	285982	25 %	0 %	75 %	0 %	126178257
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6229	NC_009051	CACCC	2	10	291184	291193	20 %	0 %	0 %	80 %	126178262
6230	NC_009051	CGAG	2	8	291212	291219	25 %	0 %	50 %	25 %	126178262
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6233	NC_009051	GA	4	8	291345	291352	50 %	0 %	50 %	0 %	126178262
6234	NC_009051	GAC	2	6	291405	291410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178263
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6239	NC_009051	CGA	3	9	291578	291586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178263
6240	NC_009051	TCG	2	6	291652	291657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178263
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6242	NC_009051	GATC	2	8	291731	291738	25 %	25 %	25 %	25 %	126178263
6243	NC_009051	GCG	2	6	291762	291767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178263
6244	NC_009051	CGA	2	6	291947	291952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178263
6245	NC_009051	TCG	3	9	291973	291981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178263
6246	NC_009051	CAT	2	6	291983	291988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178263
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6345	NC_009051	TCGA	2	8	296336	296343	25 %	25 %	25 %	25 %	126178265
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6353	NC_009051	ATC	2	6	296693	296698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178265
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6484	NC_009051	GGA	2	6	302235	302240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178270
6485	NC_009051	GTA	2	6	302311	302316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178270
6486	NC_009051	CGGG	2	8	302350	302357	0 %	0 %	75 %	25 %	126178270
6487	NC_009051	CGC	2	6	302391	302396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178270
6488	NC_009051	GGT	3	9	302400	302408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178270
6489	NC_009051	G	6	6	302420	302425	0 %	0 %	100 %	0 %	126178270
6490	NC_009051	AGG	2	6	302432	302437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178270
6491	NC_009051	CTT	3	9	302464	302472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178270
6492	NC_009051	GAG	2	6	302611	302616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178270
6493	NC_009051	CCG	2	6	302692	302697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178270
6494	NC_009051	TCG	2	6	302720	302725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178270
6495	NC_009051	AGA	2	6	302742	302747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178270
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6497	NC_009051	TCCGGT	2	12	302787	302798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178270
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